Фауна земноводных и пресмыкающихся крайне бедна. Широко по
заповеднику распространена живородящая ящерица. На побережье
Байкала обычна остромордая лягушка, очень редка дальневосточная
квакша. На южном склоне Хамар-Дабана обитают сибирский углозуб и
обыкновенный щитомордник.