В почве происходит гумификация, т.е. образование плодородного слоя почвы - гумуса - из органических остатков. Бактерии разлагают органику, оставшуюся от продуцентов (растений) и консументов (животных) до минеральных веществ, которые в последствии будут всасываться живыми растениями. Это назвается минерализация. Кроме того, в почве может накапливаться азот с помощью азотофиксирующих бактерий. Это нитрификация.