Различия:
1) Хламидомонада относится к порядку Вольвоксовые, а хлорелла - к порядку Протококковые
2)
Хламидомонада подвижна и имеет 2 жгутика и светочувствительный глазок;
хлорелла неподвижна, жгутиков и светочувствительного глазка не имеет
3) Хламидомонада, в отличие от хлореллы, имеет сократительную вакуоль
4) Споры у хламидомонады также имеют жгутики и называются зооспорами; безжгутиковые споры хлореллы называются автоспорами