Потому что гликолиз идет в бескислородной среде.
Считается, что первичная атмосфера была бескислородной, потом появились анаэробные организмы (получающие энергию путем гликолиза) , потом сине-зеленые (осуществляли процесс фотосинтеза, что привело к созданию кислородной атмосферы) , а уж потом возникло более эффективное аэробное дыхание.