1. У круглых червей есть ротовое и анальное отверстия, у плоских — только ротовое отверстие.
2. Круглые черви откладывают свободные яйца, у плоских яйца содержатся в отделившихся от червя зрелых члениках.
3. Большинство круглых червей раздельнополые. Плоские однополые.
4. Полости тела у плоских червей нет в отличие от круглых (у них имеется первичная полость тела - схизоцель).