Клітини грибів мають ядра, в клітинах бактерій ядра відсутні.Гриби можуть бути багатоклітинними і одноклітинними, бактерії є виключно одноклітинними організмами.Бактерії опанували всі середовища існування, на відміну від грибів.Гриби не здатні до активного руху, серед бактерій є види, що мають джгутики. Гриби є гетеротрофами, бактерії використовують усі відомі на сьогодні способи отримання життєвої енергії. Бактерії мають вищий рівень виживання і можливості поширення по планеті, ніж гриби.