Животные, занесенные в Красную книгу России и подлежащие охране на территории Вологодской области1. Насекомые: мнемозина (черный аполлон).
2. Рыбы: подкаменщик обыкновенный.
3. Птицы: черный аист, скопа, орлан-белохвост, беркут, змееяд, сапсан, пискулька
4. Млекопитающие: выхухоль.
Редкие животные Вологодской области1. Рыбы: семга, форель, нельмушка.
2. Земноводные: тритон гребенчатый, чесночница.
3. Пресмыкающиеся: веретенница, ящерица прыткая, уж обыкновенный, медянка.
4. Птицы: гагара краснозобая, поганка черношейная, цапля серая, лебедь-кликун, гусь серый (на гнездовье), подорлик большой, осоед, кобчик, чеглок, журавль серый, куропатка серая, кроншнеп средний, гаршнеп, кулик-сорока, крачка малая, филин, зимородок, дятел зеленый, оляпка, дрозд черный, славка ястребиная, дубонос.
5. Млекопитающие: бурозубка крошечная, ночница усатая, кожанок северный, росомаха, летяга, лемминг лесной.