Заповедник находится в лесостепной зоне. Площадь Воронежского государственного заповедника чуть более 31 тысячи гектаров. Он располагается на территории Липецкой и Воронежской областей и хранит уникальную природу Усманского бора с его богатейшей флорой и фауной. Здесь обитают 217 видов птиц,(26 живут оседло:тетеревятник,перепелятник,сизый голубь,филин,домовый сыч,серая неясыть,седой дятел,желна,пестрый дятел,средний дятел,белоспинный дятел,малый дятел,хохлатый жаворонок,сойка,сорока,серая ворона,ворон,крапивник,длиннохвостая синица,буроголовая гаичка,лазоревка,большая синица,поползень,пищуха,домовый воробей,полевой воробей;10 видов прилетают на зимовку:ушастая сова,свиристель,снегирь,московка,чиж,черноголовый щегол,коноплянка,клест,овсянка и крайне редко кедровка) 60 — млекопитающих, в том числе волки, лисицы, енотовидные собаки, кабаны, лоси, косули и благородный европейский олень. В реках и озёрах на территории заповедника встречается 39 видов рыб, 9 — земноводных, различные пресмыкающиеся и даже миноги. Лес преимущественно сосновыйс примесью дуба, но встречаются также и чистые дубравы. Сосна занимает 32%, дуб 29%, осина 19%, берёза 6% и ольха 5%. В поймах рек Усмани и Ивницы обычны ольшаники. Произрастает более 1000 видов растений. Обитают 60 видов млекопитающих:обыкновенная лисица, лось, речная выдра,волк,обыкновенный ёж обыкновенная белка, крапчатый суслик, лесная соня, обыкновенный бобр, большой тушканчик, серый хомячок, обыкновенный хомяк, рыжая полёвка, степная пеструшка, ондатра, водяная полёвка, тёмная полёвка, обыкновенная полёвка, восточноевропейская полёвка, мышь-малютка, полевая мышь, лесная мышь, желтогорлая мышь, домовая мышь, серая крыса, чёрная крыса, заяц-русак, заяц-беляк, русская выхухоль, малая белозубка, малая бурозубка, обыкновенная бурозубка, малая кутора, обыкновенная кутора,ночница Наттерера, усатая ночница, водяная ночница, прудовая ночница, бурый ушан, рыжая вечерница,гигантская вечерница, малая вечерница, лесной нетопырь, нетопырь-карлик, поздний кожан, двухцветный кожан, енотовидная собака, каменная куница, лесная куница, ласка, горностай, лесной хорёк, степной хорёк,американская норка, барсук,кабан, благородный олень, европейская косуля, подземная полёвка, мышовка-штранда. Обитание 7 видов (крапчатый суслик, большой тушканчик, серый хомячок, степная пеструшка,подземная полёвка, чёрная крыса,и степной хорёк) находится под вопросом. В заповеднике также встречаются 39 видов рыб, причём все они встречаются в реке Воронеж (на территории Воронежского заповедника) см. статью Воронеж (река), 1 вид круглоротых, 194 видов птиц, 5 видов рептилий и 7 видовамфибий. В Красную книгу России из обитающих в заповеднике занесены выхухоль, змееяд, орёл-могильник,беркут, орлан-белохвост и другие.