Наиболее существенным отличием можно выделить научную обоснованность.
Веками ранее были приведены некоторые классификации организмов, например
Лестница существ Аристотеля. Животных разделил на животных "с кровью" и "без крови" . В наше же время они именуются позвоночными и беспозвоночными.
Стоит отметить, что раньше многие исследования основывались на теологии, метафизике, креационизме, а сейчас исследования опираются на научные методы, труды предыдущих поколений и пр.