Различия почти нет, обе формулы описывают гармонические колебания с амплитудой Xmax частотой ω. Разница в фазах колебаний, несмотря на то, что Ф в обеих формулах одинаково, косинус опережает по фазе синус на четверть периода.
Различие станет понятным, если переписать первую формулу в виде
x(t)=Xmax*cos(ωt+Ф) = x(t)=Xmax*sin(ωt+Ф+π/2)
И мы видим, что от второй формулы первая отличается только фазовым сдвигом