Пятнистый олень, косуля, кабан, барсук, куница, зайцы (беляк и русак), белка, реакклиматизированые бобры (которые, кстати, крайне быстро освоились в новом месте: построили плотину, запруду, хатки и наделали бобрят) и другие.
9 видов млекопитающих, зарегистрированных в заповеднике, внесены в Красную книгу Московской области:
малая белозубка (Crocidura suaveolens крошечная бурозубка (Sorex minutissimus ночница Наттерера (Myotis nattereri прудовая ночница (Myotis dasycneme Boie),малая вечерница (Nyctalus leisleri орешниковая соня (Muscardinus avellanarius желтогорлая мышь (Apodemus flavicollisречная выдра (Lutra lutra обыкновенная рысь (Lynx lynx)