1. Двустворчатые имеют наружную раковину состоящую из двух створок. головоногие имеют лишь незначительные остатки редуцированной раковины, (например так называемая стрелка у кальмаров)
2. Головоногие имеют хорошо развитые органы зрения и способны "видеть" картинку. Двустворчатые специализировнных органов зрения не имеют.
3. Головногие моллюски для движения используют реактивное движение - засасывают воду внутрь мантийной полости, а затем резко сокращая ее двигаются в противоположную выббросу воды. Большинство двустворчатых или медленно ползают (беззубка) или вообще во взрослом состоянии полностью неподвижны (устрицы, дрейсена) . Хотя есть некоторые виды двустворчатых, которые в случае опасности могут быстро перемещатся схлопывая раковину, но ни в какое сравнение с головоногими не идут. Головоногие - отличные пловцы.
4. Все головногие имеют защитный механизм - чернильный мешок, содержимое которого выбрасывают в случае опасности. Осьминого создают дымовую завесу, а вот каракатицы выбрасывают компактную каплю и быстро меняют окраску -- нападающий хищник пытается схватить пустое место.
5. По способу питания. Головоогие - активные хищники. Двустворчатые - фильтраторы.