Представителями паразитических простейших являются дизентерийная амеба, малярийные плазмодии, представители трипаносом, лейшманий, лямблий, кокцидий, микроспоридий и др. Они являются паразитами животных и человека.
Одним из самых широко распространенных и опасных заболеваний, вызываемых паразитическими простейшими, является малярия