В состав Нижнеамударьинского физико-географического округа входят современная и древние дельты Амударьи.
На западе округ граничит с плато Устюртским, на востоке — с Кызылкумским; на севере — с Аральским округами; на юго-западе — с Туркменистаном. Площадь территории округа около 50 тысяч кв.км.
Нижнеамударьинский округ вытянут с юго-востока на северо-запад, расширяясь в этом направлении. Территория округа на юго-востоке начинается от Туямуюнской теснины и на северо-западе достигает южных уступов котловины бывшего Аральского моря. Длина округа в этом направлении составляет 400 км, ширина же изменяется.