Ответ прост!
Потому что система включает в себя только совокупность главной реки и её притоков ,которые впадают в море/озеро/океан и т.д.
Бассейн же включает в себя те же самые притоки,реку,речушки и самое главное грунтовые воды.
Грунтовые воды -вот главная причина почему площадь бассейна реки как правило больше чем площадь занятая ее системой
Будут вопросы,пиши.
Удачи!!